Ohun ìjà tuntun fún àyẹ̀wò ikọ́ ẹ̀gbẹ àti wíwá ìdènà oògùn: Ìran tuntun tí a fojúsùn sí ìtẹ̀léra (tNGS) tí a dara pọ̀ mọ́ ẹ̀rọ ẹ̀kọ́ fún àyẹ̀wò ikọ́ ẹ̀gbẹ.
Ìròyìn ìwé: CCa: àwòṣe àyẹ̀wò tí a gbé karí tNGS àti ẹ̀kọ́ ẹ̀rọ, èyí tí ó yẹ fún àwọn ènìyàn tí wọ́n ní ikọ́ ẹ̀gbẹ tí kò ní bakitéríà àti meningitis ti ikọ́ ẹ̀gbẹ.
Àkọlé ìwé àròkọ náà: Ìtẹ̀lé ìbísí ìran tuntun àti ẹ̀kọ́ ẹ̀rọ tí a gbé kalẹ̀ fún ìgbẹ́ gbuuru: ọgbọ́n ìwádìí tí ó ní ìmọ̀lára púpọ̀ fún àwọn ìgbẹ́ gbuuru ẹ̀dọ̀fóró àti àrùn meningitis onígun mẹ́rin.
Igbakọọkan: 《Clinica Chimica Acta》
Tí ó bá jẹ́: 6.5
Ọjọ́ tí a tẹ̀ jáde: Oṣù Kínní 2024
Ní ìdàpọ̀ pẹ̀lú University of Chinese Academy of Sciences àti Beijing Chest Hospital ti Capital Medical University, Macro & Micro-Test dá àwòṣe àyẹ̀wò ikọ́ ẹ̀gbẹ sílẹ̀ tí ó dá lórí ìran tuntun ti ìmọ̀ ẹ̀rọ ìfọkànsí (tNGS) àti ọ̀nà ẹ̀kọ́ ẹ̀rọ, èyí tí ó pèsè ìmọ̀lára ìwádìí gíga fún ikọ́ ẹ̀gbẹ pẹ̀lú àwọn bakitéríà díẹ̀ àti meningitis ikọ́ ẹ̀gbẹ, ó pèsè ọ̀nà àyẹ̀wò hypersensitivity tuntun fún àyẹ̀wò ikọ́ ẹ̀gbẹ méjì, ó sì ran ìwádìí pípéye, wíwá ìdènà oògùn àti ìtọ́jú ikọ́ ẹ̀gbẹ lọ́wọ́. Ní àkókò kan náà, a rí i pé a lè lo cfDNA plasma aláìsàn gẹ́gẹ́ bí irú àpẹẹrẹ tí ó yẹ fún àyẹ̀wò ikọ́ ẹ̀gbẹ nínú àyẹ̀wò TBM.
Nínú ìwádìí yìí, a lo àwọn àyẹ̀wò plasma 227 àti àwọn àyẹ̀wò omi cerebrospinal láti fi àwọn ẹgbẹ́ méjì sílẹ̀, nínú èyí tí a ti lo àwọn àyẹ̀wò àyẹ̀wò yàrá láti fi àpẹẹrẹ ẹ̀kọ́ ẹ̀rọ ti àyẹ̀wò ikọ́ ẹ̀rọ hàn, àti àwọn àyẹ̀wò àyẹ̀wò ikọ́ ẹ̀rọ láti fi hàn pé a ti fi àpẹẹrẹ àyẹ̀wò ikọ́ ẹ̀rọ hàn. Gbogbo àwọn àyẹ̀wò ni a kọ́kọ́ fojú sí nípasẹ̀ adágún ìwádìí ìwádìí tí a ṣe pàtó fún ikọ́ ẹ̀rọ Mycobacterium. Lẹ́yìn náà, ní ìbámu pẹ̀lú ìwádìí ìtẹ̀léra TB-tNGS, a lo àwòṣe igi ìpinnu láti ṣe ìfọwọ́sowọ́pọ̀ ìlọ́po márùn-ún lórí àwọn ìdánilẹ́kọ̀ọ́ àti ìfọwọ́sowọ́pọ̀ ti ìlà àyẹ̀wò yàrá, a sì gba àwọn ààlà àyẹ̀wò ti àwọn àyẹ̀wò plasma àti àwọn àyẹ̀wò omi cerebrospinal. A mú ààlà tí a rí wá sínú àwọn àyẹ̀wò méjì ti ìlà àyẹ̀wò ikọ́ ẹ̀rọ fún wíwá, a sì ṣe àyẹ̀wò iṣẹ́ àyẹ̀wò ti akẹ́kọ̀ọ́ nípa ROC curve. Níkẹyìn, a gba àwòṣe àyẹ̀wò ikọ́ ẹ̀rọ.
Àwòrán 1 àwòrán onípele ti ìwádìí
Àwọn èsì: Gẹ́gẹ́ bí àwọn ààlà pàtó ti àyẹ̀wò DNA CSF (AUC = 0.974) àti àyẹ̀wò cfDNA plasma (AUC = 0.908) tí a pinnu nínú ìwádìí yìí, láàrín àwọn àyẹ̀wò 227, ìfàmọ́ra ti àyẹ̀wò CSF jẹ́ 97.01%, ìfàmọ́ra náà jẹ́ 95.65%, àti ìfàmọ́ra àti ìfàmọ́ra ti àyẹ̀wò plasma jẹ́ 82.61% àti 86.36%. Nínú ìwádìí ti àwọn àyẹ̀wò 44 ti plasma cfDNA àti cerebrospinal fluid DNA láti ọ̀dọ̀ àwọn aláìsàn TBM, ọgbọ́n ìwádìí ti ìwádìí yìí ní ìṣọ̀kan gíga ti 90.91% (40/44) nínú plasma cfDNA àti cerebrospinal fluid DNA, àti ìfàmọ́ra náà jẹ́ 95.45% (42/44). Nínú àwọn ọmọdé tí wọ́n ní ikọ́ ẹ̀dọ̀fóró, ọgbọ́n ìwádìí ti ìwádìí yìí ní ìfàmọ́ra sí àwọn àyẹ̀wò plasma ju àwọn èsì ìwádìí Xpert ti àwọn àyẹ̀wò omi inú ikùn láti ọ̀dọ̀ àwọn aláìsàn kan náà lọ (28.57% VS 15.38%).
Àwòrán 2. Iṣẹ́ àgbéyẹ̀wò ti àwòṣe àyẹ̀wò ikọ́ ẹ̀gbẹ fún àwọn àyẹ̀wò iye ènìyàn
Àwòrán 3. Àwọn àbájáde ìwádìí àwọn àpẹẹrẹ tí a so pọ̀
Ìparí: A gbé ọ̀nà ìwádìí yìí kalẹ̀ nípa àìsàn ikọ́ ẹ̀gbẹ tí ó ní ìmọ̀lára púpọ̀, èyí tí ó lè pèsè ohun èlò ìwádìí tí ó ní ìmọ̀lára ìwádìí tí ó ga jùlọ fún àwọn aláìsàn tí wọ́n ní ikọ́ ẹ̀gbẹ oligobacillary (ìṣẹ̀dá òdì). Ṣíṣàwárí ikọ́ ẹ̀gbẹ tí ó ní ìmọ̀lára púpọ̀ tí a gbé karí plasma cfDNA lè jẹ́ àpẹẹrẹ tí ó yẹ fún àyẹ̀wò ikọ́ ẹ̀gbẹ tí ń ṣiṣẹ́ àti meningitis ti ikọ́ ẹ̀gbẹ (àwọn àpẹẹrẹ plasma rọrùn láti kó jọ ju omi cerebrospinal lọ fún àwọn aláìsàn tí a fura sí i pé wọ́n ní ikọ́ ẹ̀gbẹ ọpọlọ).
Ìjápọ̀ ìpilẹ̀ṣẹ̀: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990? via%3Dihub
Ifihan kukuru ti awọn ọja wiwa iko ati idanwo Macro & Micro-Test jara
Nítorí ipò àyẹ̀wò tó díjú fún àwọn aláìsàn ikọ́ ẹ̀gbẹ àti onírúurú àìní, Macro & Micro-Test pèsè àkójọ gbogbo àwọn ojútùú NGS fún yíyọ omi kúrò nínú àwọn àyẹ̀wò omi, ìkọ́lé àti ìtẹ̀lé ìkàwé Qualcomm, àti ìwádìí dátà. Àwọn ọjà náà bo àyẹ̀wò kíákíá fún àwọn aláìsàn ikọ́ ẹ̀gbẹ, wíwá ìkọ́ ẹ̀gbẹ tó lè dènà oògùn, irú mycobacterium ikọ́ ẹ̀gbẹ àti NTM, wíwá àyẹ̀wò hypersensitivity ti bakiteria-negative ikọ́ ẹ̀gbẹ àti àwọn ènìyàn ikọ́ ẹ̀gbẹ, àti bẹ́ẹ̀ bẹ́ẹ̀ lọ.
Àwọn ohun èlò ìwádìí onípele fún ikọ́ ẹ̀gbẹ àti mycobacteria:
| Nọmba Ohun kan | orúkọ ọjà náà | akoonu idanwo ọja | iru apẹẹrẹ | awoṣe ti o wulo |
| HWTS-3012 | Aṣoju itusilẹ apẹẹrẹ | A lo o ninu itọju liquefaction ti awọn ayẹwo sputum, o ti gba nọmba igbasilẹ kilasi akọkọ, Sutong Machinery Equipment 20230047. | ìfúnpọ̀ | |
| HWTS-NGS-P00021 | Ohun èlò ìwádìí iye Qualcomm fún ikọ́ ẹ̀gbẹ oní-ìlera (ọ̀nà ìwádìí) | Ìwádìí àìní ìfàmọ́ra tí kìí ṣe ìfọ́mọ́ra (omi biopsy) fún àkóràn-ẹ̀jẹ̀ ẹ̀dọ̀fóró àti àwọn nódù ọpọlọ; A ṣe àyẹ̀wò àwọn àpẹẹrẹ àwọn ènìyàn tí a fura sí pé wọ́n ní àkóràn-ẹ̀jẹ̀ tàbí mycobacteria tí kìí ṣe ìfọ́mọ́ra pẹ̀lú àrùn náà nípasẹ̀ ìwádìí gíga-gíga, a sì ṣe àyẹ̀wò ìwádìí bóyá àrùn-ẹ̀jẹ̀ tàbí mycobacteria tí kìí ṣe ìfọ́mọ́ra jẹ́ àkóràn náà, a sì pèsè ìwífún nípa agbára ìdènà oògùn àkọ́kọ́ ti àrùn-ẹ̀jẹ̀ mycobacterium. | Ẹ̀jẹ̀ agbeegbe, omi ìfọṣọ alveolar, hydrothorax àti ascites, àyẹ̀wò ìfọ́júsí, omi cerebrospinal. | Ìran kejì |
| HWTS-NGS-T001 | Ohun èlò ìwádìí ìtẹ̀wé Mycobacterium àti ìdènà oògùn (ọ̀nà ìtẹ̀lé ìtẹ̀léra ìtẹ̀léra multiplex) | Ìdánwò ìtẹ̀wé Mycobacterium, títí kan MTBC àti 187 NTM；Wiwa agbara oogun ti iko Mycobacterium bo awọn oogun 13 ati awọn aaye iyipada 16 ti awọn jiini agbara oogun. | Ìfun, omi ìfọṣọ alveolar, hydrothorax àti ascites, àpẹẹrẹ ìfọ́júsí, omi cerebrospinal. | Syeed meji iran keji/kẹta |
Àwọn kókó pàtàkì: HWTS-NGS-T001 Mycobacterium typing àti ohun èlò ìwádìí ìdènà oògùn (ọ̀nà ìfúnpọ̀ púpọ̀)
Ifihan ọja
Oògùn náà dá lórí àwọn oògùn àkọ́kọ́ àti ìkejì tí a ṣàlàyé nínú àwọn ìlànà ìtọ́jú TB WHO, àwọn macrolides àti aminoglycosides tí a sábà máa ń lò nínú àwọn ìlànà ìtọ́jú NTM, àti àwọn ibi ìdènà òògùn náà bo gbogbo ẹgbẹ́ kan ti àwọn ibi tí ó ní í ṣe pẹ̀lú ìdènà òògùn nínú ìwé àkójọ ìyípadà òògùn Mycobacterium tuberculosis ti WHO, àti àwọn ibi ìdènà òògùn mìíràn tí a ròyìn àti àwọn ibi ìyípadà òògùn gẹ́gẹ́ bí ìwádìí àti statistiki ti àwọn ìwé tí ó gba àmì gíga nílé àti lókè òkun.
Ìdámọ̀ ìtẹ̀wé dá lórí àwọn oríṣi NTM tí a ṣàkópọ̀ nínú ìlànà NTM tí ìwé ìròyìn Chinese Journal of Tuberculosis and Respiratory Diseases tẹ̀ jáde àti ìfohùnṣọ̀kan àwọn ògbógi. Àwọn àkọ́lé ìtẹ̀wé tí a ṣe lè mú kí ó pọ̀ sí i, kí ó tẹ̀lé wọn, kí ó sì ṣàlàyé àwọn oríṣi NTM tó ju 190 lọ.
Nípasẹ̀ ìmọ̀ ẹ̀rọ ìdàgbàsókè PCR multiplex tí a fojúsùn, a mú kí àwọn jínì genotyping àti àwọn jínì Mycobacterium tí ó lè dènà oògùn pọ̀ sí i nípa lílo multiplex PCR, a sì gba àpapọ̀ amplicon ti àwọn jínì tí a fẹ́ ṣàwárí. Àwọn ọjà tí a ti mú pọ̀ sí i lè jẹ́ àwọn ilé ìkàwé ìtẹ̀lé gíga-ìran kejì tàbí ìran kẹta, àti gbogbo àwọn ìpele ìtẹ̀lé ìran kejì àti ìran kẹta ni a lè fi sí ìtẹ̀lé gíga-gíga láti gba ìwífún ìtẹ̀lé ti àwọn jínì tí a fojúsùn. Nípa fífiwé pẹ̀lú àwọn ìyípadà tí a mọ̀ tí ó wà nínú ibi ìpamọ́ ìtọ́kasí tí a kọ́ sínú rẹ̀ (pẹ̀lú ìwé àkójọ ìyípadà ìtutù Mycobacterium ti WHO àti ìbáṣepọ̀ rẹ̀ pẹ̀lú ìdènà oògùn), a pinnu àwọn ìyípadà tí ó ní í ṣe pẹ̀lú ìdènà oògùn tàbí ìfaradà ti àwọn oògùn ìdènà-ikọ́. Pẹ̀lú ojutu ìtọ́jú àyẹ̀wò sputum tí a ṣí sílẹ̀ fúnra rẹ̀ ti Macro & Micro-Test, a yanjú ìṣòro ìdàgbàsókè acid nucleic tí ó kéré ti àwọn àyẹ̀wò sputum ìṣègùn (tí ó ga ní ìgbà mẹ́wàá ju ti àwọn ọ̀nà ìbílẹ̀ lọ), kí a lè lo ìwádìí ìdènà oògùn taara sí àwọn àyẹ̀wò sputum ìṣègùn.
Ibiti a ti n ṣawari ọja
34àwọn jínì tí ó ní í ṣe pẹ̀lú ìdènà oògùn18àwọn oògùn ìdènà ikọ́ ẹ̀gbẹ àti6Wọ́n rí àwọn oògùn NTM, wọ́n sì bo àwọn oògùn náà.297Àwọn ibi tí oògùn kò lè kojú; Irú àrùn ikọ́ ẹ̀gbẹ Mycobacterium mẹ́wàá àti jù bẹ́ẹ̀ lọ190a rí irú NTM.
Táblì 1: Ìròyìn nípa Oògùn 18+6 +190+NTM
Àǹfààní ọjà
Agbara lati ṣe atunṣe ni ile-iwosan ti o lagbara: a le rii awọn ayẹwo sputum taara pẹlu ohun elo ti o fun ni omi ara-ẹni laisi aṣa.
Iṣẹ́ àyẹ̀wò náà rọrùn: ìpele àkọ́kọ́ ti iṣẹ́ ìfúnpọ̀mọ́ra rọrùn, a sì parí kíkọ́ ilé ìkàwé láàárín wákàtí mẹ́ta, èyí tí ó mú kí iṣẹ́ náà sunwọ̀n sí i.
Ìtẹ̀wé àti ìdènà oògùn tó péye: bíbójútó àwọn ibi tí MTB àti NTM ti ń tà àti àwọn ibi tí wọ́n ti ń tà oògùn, èyí tí ó jẹ́ kókó pàtàkì nínú ọ̀ràn ìṣègùn, ìtẹ̀wé tó péye àti wíwá ìdènà oògùn, ṣíṣe àtìlẹ́yìn fún sọ́fítíwọ́ọ̀dù ìwádìí aláìdádúró, àti ṣíṣe àwọn ìròyìn ìwádìí pẹ̀lú ìtẹ̀ kan.
Ibamu: ibamu ọja, iyipada si awọn iru ẹrọ ILM ati MGI/ONT gbogbogbo.
Ìsọfúnni ọjà
| Kóòdù ọjà | orúkọ ọjà náà | Pẹpẹ ìwádìí | awọn alaye pato |
| HWTS-NGS-T001 | Ohun èlò ìwádìí ìtẹ̀wé Mycobacterium àti ohun èlò ìwádìí ìdènà oògùn (ọ̀nà ìfúnni ní ìlọ́po púpọ̀) | ONT, Illumina, MGI, Salus pro | 16/96rxn |
Àkókò ìfìwéránṣẹ́: Jan-23-2024