Ohun ija Tuntun fun Ṣiṣayẹwo Tuberculosis ati Iwaridii Resistance Oògùn: Atẹle Idojukọ Iran Tuntun (tNGS) Ni idapọ pẹlu Ẹkọ Ẹrọ fun Imọ-iṣayẹwo ikọ-ara Hypersensitivity
Ijabọ litireso: CCa: awoṣe iwadii ti o da lori tNGS ati ẹkọ ẹrọ, eyiti o dara fun awọn eniyan ti o ni iko kokoro ti o kere si ati meningitis iko.
Akọle iwe-ẹkọ: Tuberculous-ìfọkànsí atẹle-iran atẹle ati ẹkọ ẹrọ: ilana iwadii imọ-jinlẹ fun paucific pulmonary tubulars ati tubular meningitis.
Igbakọọkan: 《Clinica Chimica Acta》
TI: 6.5
Ọjọ ti atẹjade: Oṣu Kini 2024
Ni idapo pẹlu awọn University of Chinese Academy of Sciences ati Beijing Chest Hospital of Capital Medical University, Macro & Micro-Test ti iṣeto a iko ayẹwo awoṣe ti o da lori titun iran ti ìfọkànsí lesese (tNGS) ọna ẹrọ ati ẹrọ eko ọna, eyi ti o pese olekenka-ga erin ifamọ fun iko pẹlu diẹ kokoro arun ati iko meningitis, pese titun kan hypersensitivity ti awọn orisi ti tuberculoses, awọn ayẹwo ti tuberculous ọna ti awọn orisi meji. iwari oogun ati itọju ti iko. Ni akoko kanna, a rii pe cfDNA pilasima alaisan le ṣee lo bi iru apẹẹrẹ ti o dara fun iṣapẹẹrẹ ile-iwosan ni ayẹwo TBM.
Ninu iwadi yii, awọn ayẹwo pilasima 227 ati awọn ayẹwo omi cerebrospinal ni a lo lati fi idi awọn iṣọn-ẹjẹ ile-iwosan meji mulẹ, ninu eyiti a ti lo awọn ayẹwo ayẹwo ile-iwadi lati ṣe agbekalẹ awoṣe ẹkọ ẹrọ ti iṣọn-ẹjẹ iṣọn-ẹjẹ, ati awọn ayẹwo ayẹwo ayẹwo ti ile-iwosan ti a lo lati ṣe idaniloju awoṣe ayẹwo idanimọ ti iṣeto. Gbogbo awọn ayẹwo ni a kọkọ ni ifọkansi nipasẹ adagun-itumọ imudani ti a ṣe apẹrẹ pataki fun iko-ara Mycobacterium. Lẹhinna, ti o da lori data atẹle TB-tNGS, awoṣe igi ipinnu ni a lo lati ṣe ifẹsẹmulẹ-agbelebu 5-agbo lori ikẹkọ ati awọn eto afọwọsi ti isinyi iwadii yàrá, ati awọn ẹnu-ọna iwadii ti awọn ayẹwo pilasima ati awọn ayẹwo omi cerebrospinal ni a gba. Ipele ti a gba ni a mu sinu awọn eto idanwo meji ti isinyi ayẹwo ile-iwosan fun wiwa, ati pe iṣẹ ṣiṣe iwadii ti ọmọ ile-iwe jẹ iṣiro nipasẹ ọna ROC. Nikẹhin, awoṣe ayẹwo ti iko ti gba.
Aworan 1 sikematiki ti apẹrẹ iwadi
Awọn esi: Ni ibamu si awọn ipilẹ kan pato ti CSF DNA ayẹwo (AUC = 0.974) ati pilasima cfDNA ayẹwo (AUC = 0.908) ti a pinnu ninu iwadi yii, laarin awọn ayẹwo 227, ifamọ ti ayẹwo CSF jẹ 97.01%, iyasọtọ jẹ 95.65%, ati ifamọ 1% pilasima ati 8.6%. Ninu itupalẹ awọn ayẹwo 44 ti pilasima cfDNA ati DNA omi cerebrospinal lati ọdọ awọn alaisan TBM, ilana iwadii ti iwadii yii ni aitasera giga ti 90.91% (40/44) ni pilasima cfDNA ati omi cerebrospinal DNA, ati ifamọ jẹ 95.45% (42/44). Ninu awọn ọmọde ti o ni ẹdọforo ẹdọforo, ilana iwadii ti iwadii yii jẹ ifarabalẹ si awọn ayẹwo pilasima ju awọn abajade wiwa Xpert ti awọn ayẹwo oje ikun lati awọn alaisan kanna (28.57% VS 15.38%).
Aworan 2 Iṣe itupalẹ ti awoṣe ayẹwo ikọ-igbẹ fun awọn ayẹwo olugbe
Aworan 3 Awọn abajade ayẹwo ti awọn ayẹwo ti a so pọ
Ipari: Ọna iwadii hypersensitive fun iko ni a fi idi mulẹ ninu iwadi yii, eyiti o le pese ohun elo iwadii kan pẹlu ifamọ wiwa ti o ga julọ fun awọn alaisan ile-iwosan pẹlu iko oligobacillary (asa odi). Ṣiṣawari ikọ-ara hypersensitive ti o da lori pilasima cfDNA le jẹ iru apẹẹrẹ ti o yẹ fun ayẹwo ti iko ti nṣiṣe lọwọ ati meningitis iko (awọn ayẹwo pilasima rọrun lati gba ju omi cerebrospinal fun awọn alaisan ti a fura si ti iko ọpọlọ).
Atilẹba ọna asopọ: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990? nipasẹ% 3Dihub
Ifihan kukuru ti Makiro & Micro-Test tuberculosis series awọn ọja wiwa
Ni wiwo ipo ayẹwo idiju ti awọn alaisan iko ati ọpọlọpọ awọn iwulo, Makiro & Micro-Test n pese eto pipe ti awọn solusan NGS fun isediwon olomi lati awọn ayẹwo sputum, ikole ile-ikawe Qualcomm ati ilana atẹle, ati itupalẹ data. Awọn ọja naa bo ayẹwo iyara ti awọn alaisan iko, iṣawari oogun ti ikọ-igbẹ, titẹ ti iko-ara mycobacterium ati NTM, iwadii ifamọ ti kokoro-arun iko odi ati awọn eniyan iko, ati bẹbẹ lọ.
Awọn ohun elo wiwa ni tẹlentẹle fun iko ati mycobacteria:
| Nkan No | ọja orukọ | ọja igbeyewo akoonu | apẹẹrẹ iru | wulo awoṣe |
| HWTS-3012 | Aṣoju itusilẹ ayẹwo | Ti a lo ninu itọju liquefaction ti awọn ayẹwo sputum, ti gba nọmba igbasilẹ kilasi akọkọ, Sutong Machinery Equipment 20230047. | sputum | |
| HWTS-NGS-P00021 | Ohun elo wiwa opoiye Qualcomm fun iko hypersensitive (ọna imudani iwadii) | Ti kii-invasive (biosi olomi) wiwa hypersensitivity fun kokoro-arun iko ẹdọforo odi ati awọn nodules ọpọlọ; Awọn ayẹwo ti awọn eniyan ti a fura si pe o ni akoran pẹlu iko tabi ti kii ṣe iko-ara mycobacteria ni a ṣe atupale nipasẹ awọn metagenomics ti o jinlẹ ti o jinlẹ, ati alaye wiwa ti boya iko-ara tabi mycobacteria ti kii ṣe iko-ara ti ni akoran ati alaye akọkọ-akọkọ ti oogun oogun ti iko-ara mycobacterium ti pese. | Ẹjẹ agbeegbe, ito lavage alveolar, hydrothorax ati ascites, ayẹwo puncture idojukọ, omi cerebrospinal. | Iran keji |
| HWTS-NGS-T001 | Titẹ Mycobacterium ati ohun elo wiwa idena oogun (ọna ilana imudara pupọ pupọ) | Idanwo Mycobacterium titẹ, pẹlu MTBC ati 187 NTM;Ṣiṣawari ikọlu oogun ti Mycobacterium ni wiwa awọn oogun 13 ati awọn aaye iyipada pataki 16 ti awọn jiini resistance oogun. | Sputum, ito lavage alveolar, hydrothorax ati ascites, ayẹwo puncture idojukọ, omi cerebrospinal. | Keji / kẹta iran meji Syeed |
Awọn ifojusi: HWTS-NGS-T001 Titẹ Mycobacterium ati ohun elo wiwa idena oogun (ọna imudara pupọ)
ifihan ọja
Ọja naa da lori awọn oogun akọkọ-akọkọ ati laini keji ti a ṣalaye ninu awọn itọnisọna itọju TB WHO, awọn macrolides ati aminoglycosides ti o wọpọ ni awọn ilana itọju NTM, ati awọn aaye resistance oogun bo gbogbo ẹgbẹ kan ti awọn aaye ti o ni ibatan oogun ni iwe akọọlẹ iyipada ikọlu ikọ-fèé ti WHO Mycobacterium, ati awọn jiini resistance oogun miiran ati awọn aaye iyipada ti o royin ni ibamu si awọn iwadii ile ati awọn aaye ti o ga ni okeere.
Idanimọ titẹ jẹ da lori awọn igara NTM ti a ṣoki ninu awọn itọnisọna NTM ti a tẹjade nipasẹ Iwe akọọlẹ Kannada ti iko ati Arun atẹgun ati ifọkanbalẹ ti awọn amoye. Awọn alakoko titẹ ti a ṣe apẹrẹ le pọ si, lẹsẹsẹ ati ṣe alaye diẹ sii ju awọn ẹya NTM 190.
Nipasẹ imọ-ẹrọ imudara PCR multiplex ti a fojusi, awọn jiini genotyping ati awọn jiini sooro oogun ti Mycobacterium ni a pọ si nipasẹ multiplex PCR, ati pe apapọ amplicon ti awọn jiini ibi-afẹde lati rii ni a gba. Awọn ọja ti o pọ si ni a le ṣe sinu iran-keji tabi iran-kẹta ti awọn ile-ikawe ti o ni ilọsiwaju ti o ga julọ, ati gbogbo iran-keji ati awọn iru ẹrọ ipasẹ-kẹta ni a le tẹriba si ilana-ijinle giga lati gba alaye lẹsẹsẹ ti awọn jiini ibi-afẹde. Nipa ifiwera pẹlu awọn iyipada ti a mọ ti o wa ninu ibi-itọkasi itọka ti a ṣe sinu (pẹlu katalogi iyipada eka ti WHO Mycobacterium tuberculosis ati ibatan rẹ pẹlu resistance oogun), awọn iyipada ti o ni ibatan si resistance oogun tabi ifaragba ti awọn oogun egboogi-ikọ-ara ni a pinnu. Ni idapọ pẹlu ojutu itọju ayẹwo sputum ti ara ẹni ti Macro & Micro-Test, iṣoro ti iṣelọpọ nucleic acid kekere ṣiṣe ti awọn ayẹwo sputum ile-iwosan (awọn akoko mẹwa ti o ga ju ti awọn ọna ibile lọ) ti yanju, nitorinaa wiwa ipasẹ ipasẹ oogun le ṣee lo taara si awọn ayẹwo sputum ile-iwosan.
Iwọn wiwa ọja
34oògùn resistance-jẹmọ Jiini ti18oogun egboogi-ikolu ati6Awọn oogun NTM ni a rii, ti o bo297awọn aaye resistance oogun; Mẹwa iru ti Mycobacterium iko ati diẹ sii ju190awọn iru NTM ti a rii.
Table 1: Alaye ti 18 + 6 Oògùn +190 + NTM
Anfani ọja
Imudara ile-iwosan ti o lagbara: awọn ayẹwo sputum le ṣee wa-ri taara pẹlu oluranlowo olomi-ara laisi aṣa.
Iṣe idanwo jẹ rọrun: iyipo akọkọ ti iṣẹ imudara jẹ rọrun, ati ikole ile-ikawe ti pari ni awọn wakati 3, eyiti o mu imudara iṣẹ ṣiṣẹ.
Titẹ okeerẹ ati resistance oogun: ibora ti titẹ ati awọn aaye resistance oogun ti MTB ati NTM, eyiti o jẹ awọn aaye pataki ti ibakcdun ile-iwosan, titẹ deede ati iṣawari oogun oogun, atilẹyin sọfitiwia itupalẹ ominira, ati ṣiṣẹda awọn ijabọ itupalẹ pẹlu titẹ kan.
Ibamu: ibamu ọja, ni ibamu si ILM akọkọ ati awọn iru ẹrọ MGI/ONT.
ọja sipesifikesonu
| koodu ọja | ọja orukọ | Syeed erin | ni pato |
| HWTS-NGS-T001 | Titẹ Mycobacterium ati ohun elo wiwa idena oogun (ọna imudara pupọ) | ONT, Illumina, MGI, Salus pro | 16/96rxn |
Akoko ifiweranṣẹ: Jan-23-2024